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高質(zhì)量橡膠樹(shù)參考基因組成功獲得

中國(guó)科技網(wǎng)-科技日?qǐng)?bào)
2016-06-12
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  日前, 國(guó)際學(xué)術(shù)權(quán)威刊物《自然—植物》(Nature Plants)刊發(fā)了由中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院橡膠研究所唐朝榮團(tuán)隊(duì)和中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所胡松年團(tuán)隊(duì)的合作研究成果,該研究獲得了一個(gè)高質(zhì)量的橡膠樹(shù)參考基因組,并提出了橡膠物種進(jìn)化和乙烯刺激產(chǎn)膠的新觀點(diǎn)。此重大突破將有力推動(dòng)產(chǎn)膠植物的產(chǎn)膠生物學(xué)研究,為橡膠樹(shù)優(yōu)異種質(zhì)的發(fā)掘利用以及高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)抗逆遺傳改良奠定了良好基礎(chǔ)。

  目前我國(guó)天然橡膠種植面積達(dá)1700余萬(wàn)畝,年產(chǎn)量?jī)H80萬(wàn)噸左右,不足年消費(fèi)量400多萬(wàn)噸的20%。在兩千多種產(chǎn)膠植物中,巴西橡膠樹(shù)因其產(chǎn)量高、品質(zhì)好、易采集和持續(xù)生產(chǎn)周期長(zhǎng)等原因使之成為天然橡膠幾乎唯一的商業(yè)來(lái)源。橡膠樹(shù)為什么能高產(chǎn)橡膠,這種特性是否與其環(huán)境適應(yīng)和進(jìn)化相關(guān),在生產(chǎn)上的乙烯處理為何能顯著增加橡膠產(chǎn)量?這些都是產(chǎn)膠生物學(xué)研究上長(zhǎng)期懸而未決的重要理論問(wèn)題。

  橡膠樹(shù)基因組龐大,具有高雜合、高重復(fù)的特點(diǎn),對(duì)序列拼接組裝和功能解析均構(gòu)成巨大挑戰(zhàn),經(jīng)過(guò)團(tuán)隊(duì)成員五年多的不懈努力和聯(lián)合攻關(guān),成功構(gòu)建了一個(gè)高質(zhì)量的橡膠基因組圖譜,鑒定了四萬(wàn)三千多個(gè)蛋白編碼基因;發(fā)現(xiàn)在橡膠樹(shù)進(jìn)化過(guò)程中,與產(chǎn)膠密切相關(guān)的REF/SRPP基因家族發(fā)生了顯著擴(kuò)增,并且發(fā)生了乳管細(xì)胞特異性功能分化,與乳管中大橡膠粒子的發(fā)生、橡膠高產(chǎn)性狀密切相關(guān),推測(cè)是橡膠樹(shù)抗蟲(chóng)機(jī)制的重要組成部分,為橡膠物種進(jìn)化的重要推動(dòng)力;發(fā)現(xiàn)乳管內(nèi)源乙烯的合成能力很低且不受乙烯刺激誘導(dǎo),但卻存在活躍的乙烯信號(hào)應(yīng)答與傳遞通路,從源頭上闡述了乙烯刺激橡膠增產(chǎn)的原因。


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